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PlasmoDB的间日疟原虫载体序列污染以及26个序列的生物信息校正

       本研究发现在PlasmoDB上发表的间日疟原虫核苷酸数据库中,一个47个氨基酸的蛋白质序列出现了17次。编码序列分析显示多种限制性内切酶位点具有这个141 bp的核苷酸序列,它的3’末端连接着一个His6标签,表明克隆载体的起源。将载体污染的序列提交至NCBI和来自近期存储的4个间日疟全基因组测序项目的全基因组鸟枪法重叠群(WGS)进行BLASTN比对以交叉检查。在PlasmoDB数据库中至少有26个基因的预测蛋白产物含有该克隆载体序列。该研究成果2015年发表于《Parasites & Vectors》杂志。
 
 

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